Bos taurus Gene: PDGFB | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-641707.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PDGFB | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | platelet-derived growth factor subunit B precursor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000021697 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
platelet-derived growth factor subunit B
platelet-derived growth factor subunit B
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000100311:
The protein encoded by this gene is a member of the platelet-derived growth factor family. The four members of this family are mitogenic factors for cells of mesenchymal origin and are characterized by a motif of eight cysteines. This gene product can exist either as a homodimer (PDGF-BB) or as a heterodimer with the platelet-derived growth factor alpha polypeptide (PDGF-AB), where the dimers are connected by disulfide bonds. Mutations in this gene are associated with meningioma. Reciprocal translocations between chromosomes 22 and 17, at sites where this gene and that for collagen type 1, alpha 1 are located, are associated with a particular type of skin tumor called dermatofibrosarcoma protuberans resulting from unregulated expression of growth factor. Two alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:111180170-111200490 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 10 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PIP3 activates AKT signaling pathway
DAP12 signaling pathway
DAP12 interactions pathway
Platelet degranulation pathway
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+ pathway
PI3K/AKT activation pathway
GAB1 signalosome pathway
Signaling by EGFR pathway
PI3K events in ERBB4 signaling pathway
Signaling by ERBB4 pathway
PI3K events in ERBB2 signaling pathway
Signaling by ERBB2 pathway
PI-3K cascade pathway
Signaling by FGFR pathway
Signaling by SCF-KIT pathway
Downstream signal transduction pathway
Signaling by PDGF pathway
Constitutive PI3K/AKT Signaling in Cancer pathway
Signaling by FGFR in disease pathway
Signalling by NGF pathway
Signaling by EGFR in Cancer pathway
Downstream signaling of activated FGFR pathway
Extracellular matrix organization pathway
Role of LAT2/NTAL/LAB on calcium mobilization pathway
Innate Immune System pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Fc epsilon receptor (FCERI) signaling pathway
Signal Transduction pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
NGF signalling via TRKA from the plasma membrane pathway
PI3K/AKT Signaling in Cancer pathway
Signaling by the B Cell Receptor (BCR) pathway
Downstream signaling events of B Cell Receptor (BCR) pathway
Disease pathway
Hemostasis pathway
Platelet degranulation pathway
Innate Immune System pathway
Signaling by the B Cell Receptor (BCR) pathway
Signaling by ERBB2 pathway
PI3K/AKT activation pathway
Disease pathway
Hemostasis pathway
Signaling by FGFR in disease pathway
Signaling by ERBB4 pathway
Signaling by SCF-KIT pathway
PIP3 activates AKT signaling pathway
Immune System pathway
Extracellular matrix organization pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Downstream signal transduction pathway
Downstream signaling of activated FGFR pathway
Constitutive PI3K/AKT Signaling in Cancer pathway
PI3K events in ERBB4 signaling pathway
PI-3K cascade pathway
Signaling by EGFR pathway
Role of LAT2/NTAL/LAB on calcium mobilization pathway
Fc epsilon receptor (FCERI) signaling pathway
PI3K/AKT Signaling in Cancer pathway
Signalling by NGF pathway
Adaptive Immune System pathway
Signaling by PDGF pathway
GAB1 signalosome pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
NGF signalling via TRKA from the plasma membrane pathway
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+ pathway
PI3K events in ERBB2 signaling pathway
Signal Transduction pathway
Signaling by FGFR pathway
Signaling by EGFR in Cancer pathway
Downstream signaling events of B Cell Receptor (BCR) pathway
DAP12 interactions pathway
DAP12 signaling pathway
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KEGG |
Regulation of actin cytoskeleton pathway
Gap junction pathway
Renal cell carcinoma pathway
MAPK signaling pathway pathway
Melanoma pathway
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Glioma pathway
Prostate cancer pathway
Focal adhesion pathway
Pathways in cancer pathway
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Renal cell carcinoma pathway
Gap junction pathway
Melanoma pathway
Regulation of actin cytoskeleton pathway
MAPK signaling pathway pathway
Glioma pathway
Prostate cancer pathway
Focal adhesion pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH |
GPCR signaling pathway
PDGF signaling pathway pathway
GPCR signaling pathway
PDGF signaling pathway pathway
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PID NCI |
S1P1 pathway
Signaling events mediated by PTP1B
Nectin adhesion pathway
Signaling events mediated by TCPTP
S1P3 pathway
SHP2 signaling
PDGF receptor signaling network
Beta3 integrin cell surface interactions
PDGFR-beta signaling pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B1H0W5 Q58D48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 540106 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.110401 Bt.27755 Bt.97627 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001017953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC151383 BT021749 DAAA02014679 DAAA02014680 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI51384 AAX46596 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 540106 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||