Bos taurus Gene: SMAD4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-644730.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SMAD4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | mothers against decapentaplegic homolog 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000006919 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
mothers against decapentaplegic homolog 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] TGF-β signalling upregulates MIR181A2 expression through SMAD3/4-dependent promoter activation.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000141646:
This gene encodes a member of the Smad family of signal transduction proteins. Smad proteins are phosphorylated and activated by transmembrane serine-threonine receptor kinases in response to TGF-beta signaling. The product of this gene forms homomeric complexes and heteromeric complexes with other activated Smad proteins, which then accumulate in the nucleus and regulate the transcription of target genes. This protein binds to DNA and recognizes an 8-bp palindromic sequence (GTCTAGAC) called the Smad-binding element (SBE). The Smad proteins are subject to complex regulation by post-translational modifications. Mutations or deletions in this gene have been shown to result in pancreatic cancer, juvenile polyposis syndrome, and hereditary hemorrhagic telangiectasia syndrome. [provided by RefSeq, Oct 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 24:50993949-51045661 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 205 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TGF_beta_Receptor pathway
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REACTOME |
TGF-beta receptor signaling activates SMADs pathway
Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity pathway
SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription pathway
Signaling by Activin pathway
Signaling by BMP pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Signaling by NODAL pathway
SMAD4 MH2 Domain Mutants in Cancer pathway
Developmental Biology pathway
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells pathway
Loss of Function of SMAD4 in Cancer pathway
Loss of Function of SMAD2/3 in Cancer pathway
Signaling by TGF-beta Receptor Complex in Cancer pathway
TGFBR2 MSI Frameshift Mutants in Cancer pathway
Signal Transduction pathway
Transcriptional activity of SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer pathway
SMAD2/3 MH2 Domain Mutants in Cancer pathway
Loss of Function of TGFBR2 in Cancer pathway
SMAD2/3 Phosphorylation Motif Mutants in Cancer pathway
TGFBR1 KD Mutants in Cancer pathway
Loss of Function of TGFBR1 in Cancer pathway
TGFBR1 LBD Mutants in Cancer pathway
TGFBR2 Kinase Domain Mutants in Cancer pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
Signaling by TGF-beta Receptor Complex pathway
SMAD2/3 Phosphorylation Motif Mutants in Cancer pathway
Disease pathway
Loss of Function of SMAD4 in Cancer pathway
Signaling by TGF-beta Receptor Complex in Cancer pathway
Signaling by BMP pathway
TGFBR1 LBD Mutants in Cancer pathway
TGF-beta receptor signaling activates SMADs pathway
Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity pathway
Signaling by NODAL pathway
Loss of Function of TGFBR2 in Cancer pathway
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells pathway
Signaling by Activin pathway
SMAD2/3 MH2 Domain Mutants in Cancer pathway
TGFBR2 Kinase Domain Mutants in Cancer pathway
Gene Expression pathway
Developmental Biology pathway
Loss of Function of TGFBR1 in Cancer pathway
TGFBR2 MSI Frameshift Mutants in Cancer pathway
SMAD4 MH2 Domain Mutants in Cancer pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Signal Transduction pathway
TGFBR1 KD Mutants in Cancer pathway
Transcriptional activity of SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer pathway
Signaling by TGF-beta Receptor Complex pathway
Loss of Function of SMAD2/3 in Cancer pathway
SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription pathway
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KEGG |
Colorectal cancer pathway
Wnt signaling pathway pathway
TGF-beta signaling pathway pathway
Cell cycle pathway
Adherens junction pathway
Chronic myeloid leukemia pathway
Pancreatic cancer pathway
Pathways in cancer pathway
TGF-beta signaling pathway pathway
Wnt signaling pathway pathway
Colorectal cancer pathway
Cell cycle pathway
Adherens junction pathway
Chronic myeloid leukemia pathway
Pancreatic cancer pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH |
Wnt signaling pathway pathway
LIF signaling pathway
TGF-beta signaling pathway
BMP2 signaling pathway
Wnt signaling pathway pathway
LIF signaling pathway
BMP2 signaling pathway
TGF-beta signaling pathway
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PID NCI |
ALK2 signaling events
BMP receptor signaling
Validated nuclear estrogen receptor alpha network
ALK1 signaling events
Validated targets of C-MYC transcriptional repression
Validated targets of C-MYC transcriptional activation
LKB1 signaling events
Regulation of nuclear SMAD2/3 signaling
HIF-1-alpha transcription factor network
TGF-beta receptor signaling
Regulation of cytoplasmic and nuclear SMAD2/3 signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B0JYL0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 540248 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.109310 Bt.13220 Bt.70601 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001076209 XM_005224250 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC151330 DAAA02057034 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI51331 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 540248 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||