Bos taurus Gene: ARF6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-648584.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ARF6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Uncharacterized protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000045980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ADP-ribosylation factor 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] ARF6 has a pivotal role in TLR9-mediated immune signaling by regulating the cellular uptake of CpG oligodeoxynucleotides.
[Homo sapiens] ARF6 regulates LPS internalization and LPS-induced relocation of TICAM2 (TRAM), which is required for the MyD88-independent TLR4 signalling cascade.
[Mus musculus] Arf6 has a pivotal role in Tlr9-mediated immune signaling by regulating the cellular uptake of CpG oligodeoxynucleotides.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000165527:
This gene encodes a member of the human ARF gene family, which is part of the RAS superfamily. The ARF genes encode small guanine nucleotide-binding proteins that stimulate the ADP-ribosyltransferase activity of cholera toxin and play a role in vesicular trafficking and as activators of phospholipase D. The product of this gene is localized to the plasma membrane, and regulates vesicular trafficking, remodelling of membrane lipids, and signaling pathways that lead to actin remodeling. A pseudogene of this gene is located on chromosome 7. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:42902260-42902938 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 128 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Fc gamma R-mediated phagocytosis pathway
Endocytosis pathway
Fc gamma R-mediated phagocytosis pathway
Endocytosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
E-cadherin signaling in the nascent adherens junction
Signaling events mediated by Hepatocyte Growth Factor Receptor (c-Met)
Class I PI3K signaling events
Plexin-D1 Signaling
Alpha4 beta1 integrin signaling events
Arf6 downstream pathway
Stabilization and expansion of the E-cadherin adherens junction
Arf6 trafficking events
Arf6 signaling events
Posttranslational regulation of adherens junction stability and dissassembly
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G3N3N1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 100294979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_003582708 XM_003586562 XM_005193646 XM_005193647 XM_005211734 XM_005211735 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:659 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02028682 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 100294979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript Frequencies | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tag Count based mRNA-Abundances across 87 different Tissues (TPM).
Based on Data from Bovine Gene Atlas |
(Move your mouse over the image to view a more detailed version) |
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