Version 5.4
| Homo sapiens Gene: PTPN18 | |||||||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-69787.6 | ||||||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | PTPN18 | ||||||||||||||||||||||
| Gene Name | protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18 (brain-derived) | ||||||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000072135 | ||||||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18 (brain-derived)
protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18 (brain-derived)
protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18 (brain-derived)
protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18 (brain-derived)
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| Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
| Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the protein tyrosine phosphatase (PTP) family. PTPs are known to be signaling molecules that regulate a variety of cellular processes including cell growth, differentiation, the mitotic cycle, and oncogenic transformation. This PTP contains a PEST motif, which often serves as a protein-protein interaction domain, and may be related to protein intracellular half-live. This protein can differentially dephosphorylate autophosphorylated tyrosine kinases that are overexpressed in tumor tissues, and it appears to regulate HER2, a member of the epidermal growth factor receptor family of receptor tyrosine kinases. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2008] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 2:130356007-130375409 | ||||||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
| Band | q21.1 | ||||||||||||||||||||||
| Transcripts | |||||||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathways | |||||||||||||||||||||||
| NETPATH |
EGFR1 pathway
BCR pathway
TSLP pathway
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| REACTOME | |||||||||||||||||||||||
| KEGG | |||||||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.516390 Hs.743240 | ||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_001142370 NM_014369 XM_006712415 | ||||||||||||||||||||||
| HUGO | |||||||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS2161 CCDS46410 | ||||||||||||||||||||||
| HPRD | 05961 | ||||||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||||||
| EMBL | |||||||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||