Homo sapiens Gene: RPL17 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-702139.2 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RPL17 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ribosomal protein L17 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | L17; PD-1; RPL23 | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000265681 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ribosomal protein L17
ribosomal protein L17
ribosomal protein L17
ribosomal protein L17
ribosomal protein L17
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Ribosomes, the organelles that catalyze protein synthesis, consist of a small 40S subunit and a large 60S subunit. Together these subunits are composed of 4 RNA species and approximately 80 structurally distinct proteins. This gene encodes a ribosomal protein that is a component of the 60S subunit. The protein belongs to the L22P family of ribosomal proteins. It is located in the cytoplasm. This gene has been referred to as rpL23 because the encoded protein shares amino acid identity with ribosomal protein L23 from Halobacterium marismortui; however, its official symbol is RPL17. As is typical for genes encoding ribosomal proteins, there are multiple processed pseudogenes of this gene dispersed through the genome. Alternative splicing results in multiple transcript variants. Read-through transcription also exists between this gene and the neighboring downstream C18orf32 (chromosome 18 open reading frame 32) gene. [provided by RefSeq, Dec 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:49488453-49492565 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | q21.1 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 105 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) pathway
GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit pathway
Formation of a pool of free 40S subunits pathway
Eukaryotic Translation Termination pathway
Peptide chain elongation pathway
Eukaryotic Translation Elongation pathway
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane pathway
Viral mRNA Translation pathway
Eukaryotic Translation Initiation pathway
Influenza Infection pathway
Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway
Influenza Viral RNA Transcription and Replication pathway
Translation pathway
Metabolism of proteins pathway
Cap-dependent Translation Initiation pathway
Influenza Life Cycle pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
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KEGG |
Ribosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000985 NM_001035006 NM_001199340 NM_001199341 NM_001199342 NM_001199343 NM_001199344 NM_001199345 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS45865 CCDS56070 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04715 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||