Homo sapiens Gene: SYNE1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-98013.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SYNE1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | spectrin repeat containing, nuclear envelope 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 8B; ARCA1; C6orf98; CPG2; dJ45H2.2; EDMD4; MYNE1; Nesp1; SCAR8 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000131018 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
spectrin repeat containing, nuclear envelope 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a spectrin repeat containing protein expressed in skeletal and smooth muscle, and peripheral blood lymphocytes, that localizes to the nuclear membrane. Mutations in this gene have been associated with autosomal recessive spinocerebellar ataxia 8, also referred to as autosomal recessive cerebellar ataxia type 1 or recessive ataxia of Beauce. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:152121684-152637801 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q25.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 34 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Meiotic synapsis pathway
Cell Cycle pathway
Meiosis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.12967 Hs.737852 Hs.738925 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_033071 NM_182961 XM_006715407 XM_006715408 XM_006715409 XM_006715410 XM_006715412 XM_006715413 XM_006715415 XM_006715416 XM_006715418 XM_006715419 XM_006715423 XM_006715424 XM_006715425 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5235 CCDS5236 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 09762 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||