Homo sapiens Protein: DHX9 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-105282.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | DHX9 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 9 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | DDX9; LKP; NDH2; NDHII; RHA; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000356520 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-105280 (DHX9) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Unwinds double-stranded DNA and RNA in a 3' to 5' direction. Alteration of secondary structure may subsequently influence interactions with proteins or other nucleic acids. Functions as a transcriptional activator. Component of the CRD- mediated complex that promotes MYC mRNA stability. Involved with LARP6 in the stabilization of type I collagen mRNAs for CO1A1 and CO1A2. As component of a large PER complex is involved in the inhibition of 3' transcriptional termination of circadian target genes such as PER1 and NR1D1 and the control of the circadian rhythms. Positively regulates HIV-1 LTR-directed gene expression. {ECO:0000269PubMed:19029303, ECO:0000269PubMed:19229320, ECO:0000269PubMed:22190748}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus, nucleolus. Cytoplasm. Note=Localized in cytoplasmic mRNP granules containing untranslated mRNAs. Can shuttle between nucleus and cytoplasm. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 246 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001650
Helicase, C-terminal IPR007502 Helicase-associated domain IPR011545 DEAD/DEAH box helicase domain IPR011709 Domain of unknown function DUF1605 IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR014720 Double-stranded RNA-binding domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00271
PF04408 PF00270 PF07717 PF00035 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00490
SM00847 SM00487 SM00358 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q08211 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q08211 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1660 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.595125 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001348 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2750 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 603115 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS41444 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 04386 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB451248 AB451372 AL355999 AL662837 BC025245 BC058896 BC107881 BC137136 CH471067 L13848 U03643 Y10658 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA03571 AAB48855 AAH25245 AAH58896 AAI07882 AAI37137 BAG70062 BAG70186 CAA71668 CAH71701 CAI19277 EAW91138 | ||||||||||||||||||||||