Mus musculus Protein: Smc6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-128799.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Smc6 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | structural maintenance of chromosomes 6 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2810489L22Rik; 3830418C19Rik; AA990493; AU018782; AW742439; mKIAA4103; SMC-6; Smc6l1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000020931 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-128797 (Smc6) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Core component of the SMC5-SMC6 complex, a complex involved in repair of DNA double-strand breaks by homologous recombination. The complex may promote sister chromatid homologous recombination by recruiting the SMC1-SMC3 cohesin complex to double-strand breaks. The complex is required for telomere maintenance via recombination and mediates sumoylation of shelterin complex (telosome) components (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:11408570}. Chromosome {ECO:0000269PubMed:11408570}. Chromosome, telomere {ECO:0000250}. Note=Associates with chromatin. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 10 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 13 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1914491 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003395
RecF/RecN/SMC, N-terminal IPR010935 SMCs flexible hinge IPR010989 t-SNARE IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF02463
PF06470 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00968
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q924W5 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q924W5 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 67241 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.472390 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_079971 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Smc6 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS25815 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AJ310552 AK003872 AK009009 AK011982 AK012626 AK014442 AK050341 AK088002 AK135873 AK148478 AK220488 BC026429 BC048790 BC090630 BC099955 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH26429 AAH48790 AAH90630 AAH99955 BAB23051 BAB26022 BAB27956 BAB28365 BAB29353 BAC34200 BAC40087 BAD90287 BAE22709 BAE28576 CAC39250 | ||||||||||||||||||||||