Homo sapiens Protein: CDK13 | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-13279.5 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CDK13 | ||||||||||||||||||||
Protein Name | cyclin-dependent kinase 13 | ||||||||||||||||||||
Synonyms | CDC2L; CDC2L5; CHED; hCDK13; | ||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000181839 | ||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-13277 (CDK13) | ||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||
Function | Cyclin-dependent kinase which displays CTD kinase activity and is required for RNA splicing. Has CTD kinase activity by hyperphosphorylating the C-terminal heptapeptide repeat domain (CTD) of the largest RNA polymerase II subunit RPB1, thereby acting as a key regulator of transcription elongation. Required for RNA splicing, probably by phosphorylating SRSF1/SF2. Required during hematopoiesis. In case of infection by HIV-1 virus, interacts with HIV-1 Tat protein acetylated at 'Lys-50' and 'Lys- 51', thereby increasing HIV-1 mRNA splicing and promoting the production of the doubly spliced HIV-1 protein Nef. {ECO:0000269PubMed:16721827, ECO:0000269PubMed:1731328, ECO:0000269PubMed:18480452, ECO:0000269PubMed:20952539}. | ||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle {ECO:0000269PubMed:16721827}. | ||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in fetal brain, liver, muscle and in adult brain. Also expressed in neuroblastoma and glioblastoma tumors. | ||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 24 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000719
Protein kinase domain IPR001245 Serine-threonine/tyrosine-protein kinase catalytic domain IPR002290 Serine/threonine/dual specificity protein kinase, catalytic domain IPR011009 Protein kinase-like domain IPR020635 Tyrosine-protein kinase, catalytic domain |
||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00069
PF07714 |
||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR00109
|
||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||
SMART |
SM00220
SM00219 |
||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | Q14004 | ||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q14004 | ||||||||||||||||||||
TrEMBL | A0A024RA85 | ||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 8621 | ||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.701006 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_003709 | ||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1733 | ||||||||||||||||||||
OMIM | 603309 | ||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5461 | ||||||||||||||||||||
HPRD | 04496 | ||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | AB058694 AC006023 AC072061 AJ297709 AJ297710 AK223053 AY679523 CH471073 M80629 | ||||||||||||||||||||
GenPept | AAA58424 AAD54514 AAS07490 AAS07491 AAT74623 BAB47420 BAD96773 CAC10400 CAC10401 EAW94128 EAW94129 | ||||||||||||||||||||