Mus musculus Protein: Vcp | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-139757.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Vcp | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | valosin containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000030164 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-139755 (Vcp) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Necessary for the fragmentation of Golgi stacks during mitosis and for their reassembly after mitosis. Involved in the formation of the transitional endoplasmic reticulum (tER). The transfer of membranes from the endoplasmic reticulum to the Golgi apparatus occurs via 50-70 nm transition vesicles which derive from part-rough, part-smooth transitional elements of the endoplasmic reticulum (tER). Vesicle budding from the tER is an ATP-dependent process. The ternary complex containing UFD1L, VCP and NPLOC4 binds ubiquitinated proteins and is necessary for the export of misfolded proteins from the ER to the cytoplasm, where they are degraded by the proteasome. The NPLOC4-UFD1L-VCP complex regulates spindle disassembly at the end of mitosis and is necessary for the formation of a closed nuclear envelope. Regulates E3 ubiquitin-protein ligase activity of RNF19A (By similarity). Component of the VCP/p97-AMFR/gp78 complex that participates in the final step of the sterol-mediated ubiquitination and endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) of HMGCR. Also involved in DNA damage response: recruited to double-strand breaks (DSBs) sites in a RNF8- and RNF168- dependent manner and promotes the recruitment of TP53BP1 at DNA damage sites. Recruited to stalled replication forks by SPRTN: may act by mediating extraction of DNA polymerase eta (POLH) to prevent excessive translesion DNA synthesis and limit the incidence of mutations induced by DNA damage (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, cytosol. Nucleus. Endoplasmic reticulum {ECO:0000250}. Note=Recruited to the cytoplasmic surface of the endoplasmic reticulum via interaction with AMFR/gp78. Following DNA double-strand breaks, recruited to the sites of damage. Recruited to stalled replication forks via interaction with SPRTN (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 109 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 442 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:99919 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003338
CDC48, N-terminal subdomain IPR003593 AAA+ ATPase domain IPR003959 ATPase, AAA-type, core IPR004201 CDC48, domain 2 IPR005938 AAA ATPase, CDC48 family IPR008824 DNA helicase, Holliday junction RuvB type, N-terminal IPR009010 Aspartate decarboxylase-like domain IPR011704 ATPase, dynein-related, AAA domain IPR015415 Vps4 oligomerisation, C-terminal IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase IPR029067 CDC48 domain 2-like |
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PFAM |
PF02359
PF00004 PF07724 PF13304 PF02933 PF05496 PF07728 PF09336 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM01073
SM00382 SM01072 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q01853 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q01853 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8BNF8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 269523 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.484065 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_033529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | 3CF3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Vcp | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS18086 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK028264 AK030751 AK083821 AK149931 AK151109 AK151418 AK153249 AK159177 AK159509 AK167794 AK169140 AL672276 BC043053 BC049114 Z14044 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH43053 AAH49114 BAC25849 BAC27119 BAC39028 BAE29175 BAE30119 BAE30383 BAE31840 BAE34876 BAE35141 BAE39824 BAE40919 CAA78412 CAM14316 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||