Homo sapiens Protein: RFC1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-14030.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RFC1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | replication factor C (activator 1) 1, 145kDa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | A1; MHCBFB; PO-GA; RECC1; RFC; RFC140; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000371321 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-14028 (RFC1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | The elongation of primed DNA templates by DNA polymerase delta and epsilon requires the action of the accessory proteins PCNA and activator 1. This subunit binds to the primer-template junction. Binds the PO-B transcription element as well as other GA rich DNA sequences. Could play a role in DNA transcription regulation as well as DNA replication and/or repair. Can bind single- or double-stranded DNA. {ECO:0000269PubMed:8999859}.Interacts with C-terminus of PCNA. 5' phosphate residue is required for binding of the N-terminal DNA-binding domain to duplex DNA, suggesting a role in recognition of non-primer template DNA structures during replication and/or repair. {ECO:0000269PubMed:8999859}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Wide tissue distribution. Undetectable in placental tissue. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 60 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001357
BRCT domain IPR003593 AAA+ ATPase domain IPR003959 ATPase, AAA-type, core IPR008921 DNA polymerase III, clamp loader complex, gamma/delta/delta subunit, C-terminal IPR012178 DNA replication factor C, large subunit IPR013725 DNA replication factor RFC1, C-terminal IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00533
PF12738 PF00004 PF07724 PF13304 PF08519 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF036578
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SMART |
SM00292
SM00382 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P35251 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P35251 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5981 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.595029 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001191676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 102579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS56329 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF040250 AK291612 AY600371 BC035297 BC051751 BC051786 CH471069 L23320 Z22642 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA16121 AAB99788 AAH35297 AAH51751 AAH51786 AAS94325 BAF84301 CAA80355 EAW92923 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||