Mus musculus Protein: Cacna1b | |||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-142651.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cacna1b | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | calcium channel, voltage-dependent, N type, alpha 1B subunit | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | alpha(1B); AW050276; AW060892; AW822256; Cav2.2; Cchn1a; | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000037416 | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-142643 (Cacna1b) | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Function | Voltage-sensitive calcium channels (VSCC) mediate the entry of calcium ions into excitable cells and are also involved in a variety of calcium-dependent processes, including muscle contraction, hormone or neurotransmitter release, gene expression, cell motility, cell division and cell death. The isoform alpha-1B gives rise to N-type calcium currents. N-type calcium channels belong to the 'high-voltage activated' (HVA) group and are blocked by omega-conotoxin-GVIA (omega-CTx-GVIA) and by omega-agatoxin- IIIA (omega-Aga-IIIA). They are however insensitive to dihydropyridines (DHP), and omega-agatoxin-IVA (omega-Aga-IVA). Calcium channels containing alpha-1B subunit may play a role in directed migration of immature neurons. | ||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Membrane; Multi-pass membrane protein. | ||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widespread expression throughout the brain. Highest levels in pyramidal cell layers C1, C2 and C3 of the hippocampus, in the dentate gyrus, in the cortex layers 2 et 4, in the subiculum and the habenula. | ||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:88296 | ||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002048
EF-hand domain IPR002077 Voltage-dependent calcium channel, alpha-1 subunit IPR003915 Polycystic kidney disease type 2 protein IPR005447 Voltage-dependent calcium channel, N-type, alpha-1 subunit IPR005821 Ion transport domain IPR013122 Polycystin cation channel, PKD1/PKD2 IPR014873 Voltage-dependent calcium channel, alpha-1 subunit, IQ domain |
||||||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00036
PF13202 PF13405 PF00520 PF08016 PF08763 |
||||||||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR00167
PR01433 PR01631 |
||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00054
SM01062 |
||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O55017 | ||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O55017 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12287 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.4424 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001035993 | ||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Cacna1b | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38065 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF042317 U04999 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB60437 AAB97840 | ||||||||||||||||||||||||||