Mus musculus Protein: Fads1 | |||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-143405.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Fads1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | fatty acid desaturase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 0710001O03Rik; A930006B21Rik; AI317215; DSD; | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000010807 | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-143403 (Fads1) | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Function | Component of a lipid metabolic pathway that catalyzes biosynthesis of highly unsaturated fatty acids (HUFA) from precursor essential polyunsaturated fatty acids (PUFA) linoleic acid (LA) (18:2n-6) and alpha-linolenic acid (ALA) (18:3n-3). Catalyzes the desaturation of dihomo-gamma-linoleic acid (DHGLA) (20:3n-6) and eicosatetraenoic acid (20:4n-3) to generate arachidonic acid (AA) (20:4n-6) and eicosapentaenoic acid (EPA)(20:5n-3) respectively (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Endoplasmic reticulum membrane {ECO:0000250}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000250}. Mitochondrion {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Highly expressed in the adrenal gland, liver, brain, and testis, tissues where lipogenesis and steroidogenesis are active. {ECO:0000269PubMed:11792729}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1923517 | ||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001199
Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain IPR005804 Fatty acid desaturase, type 1 IPR012171 Fatty acid/sphingolipid desaturase |
||||||||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00173
PF00487 |
||||||||||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR00363
|
||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF015921
|
||||||||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q920L1 | ||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q920L1 | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 76267 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.406115 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_666206 | ||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Fads1 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29572 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB072976 AK033308 AK083959 AK154367 BC022139 BC026831 BC026848 BC063053 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH22139 AAH26831 AAH26848 AAH63053 BAB69894 BAC28228 BAC39079 BAE32539 | ||||||||||||||||||||||||||||