Mus musculus Protein: Rbm22 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-149936.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rbm22 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | RNA binding motif protein 22 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 8430430L24Rik; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000025506 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-149934 (Rbm22) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Involved in the first step of pre-mRNA splicing. Binds directly to the internal stem-loop (ISL) domain of the U6 snRNA and to the pre-mRNA intron near the 5' splice site during the activation and catalytic phases of the spliceosome cycle. Involved in both translocations of the nuclear SLU7 to the cytoplasm and the cytosolic calcium-binding protein PDCD6 to the nucleus upon cellular stress responses (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Cytoplasm {ECO:0000250}. Note=Mainly located in the nucleus. Translocated from the nucleus to the cytoplasm after heat shock cell treatment. May be shuttling between the nucleus and the cytosol (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1914060 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR000571 Zinc finger, CCCH-type IPR001878 Zinc finger, CCHC-type |
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PFAM |
PF00076
PF00642 PF00098 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
SM00356 SM00343 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8BHS3 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8BHS3 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 66810 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.400830 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_080052 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rbm22 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29272 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK018452 AK045116 AK150271 AK151758 AK152252 AK166600 AK167509 AK168919 BC080205 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH80205 BAB31220 BAC32229 BAE29427 BAE30665 BAE31073 BAE38885 BAE39585 BAE40732 | ||||||||||||||||||||||