Mus musculus Protein: Phf2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-149939.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Phf2 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | PHD finger protein 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | GRC5; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000047308 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-149937 (Phf2) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Lysine demethylase that demethylates both histones and non-histone proteins. Enzymatically inactive by itself, and becomes active following phosphorylation by PKA: forms a complex with ARID5B and mediates demethylation of methylated ARID5B. Demethylation of ARID5B leads to target the PHF2-ARID5B complex to target promoters, where PHF2 mediates demethylation of dimethylated 'Lys-9' of histone H3 (H3K9me2), followed by transcription activation of target genes. The PHF2-ARID5B complex acts as a coactivator of HNF4A in liver. PHF2 is recruited to trimethylated 'Lys-4' of histone H3 (H3K4me3) at rDNA promoters and promotes expression of rDNA (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus, nucleolus {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1338034 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001965
Zinc finger, PHD-type IPR003347 JmjC domain IPR011011 Zinc finger, FYVE/PHD-type IPR019787 Zinc finger, PHD-finger |
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PFAM |
PF02373
PF08007 PF00628 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00249
SM00558 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9WTU0 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9WTU0 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 18676 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.486213 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_035208 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Phf2 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26496 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC109249 AF043726 AK172995 BC051633 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD21792 AAH51633 BAD32273 | ||||||||||||||||||||||