Mus musculus Protein: Prpf4 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-153134.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Prpf4 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | PRP4 pre-mRNA processing factor 4 homolog (yeast) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1600015H11Rik; AI874830; AW047464; bN189G18.1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000081572 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-153132 (Prpf4) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Participates in pre-mRNA splicing. Part of the U4/U5/U6 tri-snRNP complex, one of the building blocks of the spliceosome (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle {ECO:0000250}. Note=Colocalizes with spliceosomal snRNPs. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 62 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1917302 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001680
WD40 repeat IPR003648 Splicing factor motif IPR014906 Pre-mRNA processing factor 4 (PRP4)-like IPR017986 WD40-repeat-containing domain IPR020472 G-protein beta WD-40 repeat |
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PFAM |
PF00400
PF08799 |
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PRINTS |
PR00320
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00320
SM00500 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9DAW6 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9DAW6 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q80WA7 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 70052 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.416647 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_081573 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Prpf4 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS18239 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK005464 AK089838 AK166912 AK167216 AK169532 BC051639 BC106089 BC125529 BC125531 CH466527 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH51639 AAI06090 AAI25530 AAI25532 BAB24055 BAC40976 BAE39112 BAE39342 BAE41214 EDL31148 | ||||||||||||||||||||||