Mus musculus Protein: Rbm25 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-155377.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rbm25 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | RNA binding motif protein 25 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2600011C06Rik; 2610015J01Rik; A130095G20Rik; AI159652; AL023075; AU043498; RNPC7; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000048470 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-155375 (Rbm25) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | RNA-binding protein that acts as a regulator of alternative pre-mRNA splicing. Involved in apoptotic cell death through the regulation of the apoptotic factor BCL2L1 isoform expression. Modulates the ratio of proapoptotic BCL2L1 isoform S to antiapoptotic BCL2L1 isoform L mRNA expression. When overexpressed, stimulates proapoptotic BCL2L1 isoform S 5'-splice site (5'-ss) selection, whereas its depletion caused the accumulation of antiapoptotic BCL2L1 isoform L. Promotes BCL2L1 isoform S 5'-ss usage through the 5'-CGGGCA-3' RNA sequence. Its association with LUC7L3 promotes U1 snRNP binding to a weak 5' ss in a 5'-CGGGCA-3'-dependent manner. Binds to the exonic splicing enhancer 5'-CGGGCA-3' RNA sequence located within exon 2 of the BCL2L1 pre-mRNA (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00627}. Cytoplasm {ECO:0000250}. Note=Colocalizes predominantly, with SFRS2 and LUC7L3 splicing factors, in nuclear speckles. Cytoplasmic localization is faint (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 34 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1914289 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR002483 PWI domain |
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PFAM |
PF00076
PF01480 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
SM00311 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | B2RY56 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-B2RY56 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | S4R2B1 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 67039 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.471822 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_081625 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rbm25 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS49107 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC055772 AK011184 AK011403 AK076553 AK087936 AK142132 AK151910 AK164367 BC010792 BC066150 BC067400 BC158104 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH10792 AAH66150 AAH67400 AAI58105 BAB27451 BAB27595 BAC36389 BAC40049 BAE24941 BAE30791 BAE37760 | ||||||||||||||||||||||