Mus musculus Protein: Prf1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-155741.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Prf1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | perforin 1 (pore forming protein) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Pfn; Pfp; Prf-1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000041483 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-155739 (Prf1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Plays a key role in secretory granule-dependent cell death, and in defense against virus-infected or neoplastic cells. Can insert into the membrane of target cells in its calcium-bound form, oligomerize and form large pores. Promotes cytolysis and apoptosis of target cells by facilitating the uptake of cytotoxic granzymes. {ECO:0000269PubMed:19446473, ECO:0000269PubMed:21037563, ECO:0000269PubMed:3261391, ECO:0000269PubMed:7526382, ECO:0000269PubMed:8164737}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasmic granule lumen. Secreted. Cell membrane; Multi-pass membrane protein. Endosome lumen {ECO:0000250}. Note=Stored in cytoplasmic granules of cytolytic T- lymphocytes and secreted into the cleft between T-lymphocyte and target cell. May be taken up via endocytosis involving clathrin- coated vesicles and accumulate in a first time in large early endosomes (By similarity). Inserts into the cell membrane of target cells and forms pores. Membrane insertion and pore formation requires a major conformation change. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Detected in cytotoxic T-lymphocytes and natural killer cells. {ECO:0000269PubMed:2040805, ECO:0000269PubMed:2783486, ECO:0000269PubMed:3261391}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:97551 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000008
C2 domain IPR020864 Membrane attack complex component/perforin (MACPF) domain |
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PFAM |
PF00168
PF01823 |
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PRINTS |
PR00360
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00239
SM00457 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P10820 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P10820 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A2RSY7 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 18646 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.240313 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_035203 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | 3NSJ | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Prf1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS23875 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | BC132300 BC137962 CH466553 J04148 M23182 M95527 X12760 X51340 X51446 X60165 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA39909 AAA39910 AAB01574 AAI32301 AAI37963 CAA31251 CAA35721 CAA42731 EDL32148 EDL32149 | ||||||||||||||||||||||