Homo sapiens Protein: NPC1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-1602.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NPC1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Niemann-Pick disease, type C1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | NPC; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000269228 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-1600 (NPC1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Intracellular cholesterol transporter which acts in concert with NPC2 and plays an important role in the egress of cholesterol from the endosomal/lysosomal compartment. Both NPC1 and NPC2 function as the cellular 'tag team duo' (TTD) to catalyze the mobilization of cholesterol within the multivesicular environment of the late endosome (LE) to effect egress through the limiting bilayer of the LE. NPC2 binds unesterified cholesterol that has been released from LDLs in the lumen of the late endosomes/lysosomes and transfers it to the cholesterol-binding pocket of the N-terminal domain of NPC1. Cholesterol binds to NPC1 with the hydroxyl group buried in the binding pocket and is exported from the limiting membrane of late endosomes/ lysosomes to the ER and plasma membrane by an unknown mechanism. Binds oxysterol with higher affinity than cholesterol. May play a role in vesicular trafficking in glia, a process that may be crucial for maintaining the structural and functional integrity of nerve terminals. {ECO:0000269PubMed:18772377, ECO:0000269PubMed:19563754}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Late endosome membrane {ECO:0000269PubMed:17897319}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000269PubMed:17897319}. Lysosome membrane {ECO:0000269PubMed:17897319}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000269PubMed:17897319}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Niemann-Pick disease C1 (NPC1) [MIM:257220]: A lysosomal storage disorder that affects the viscera and the central nervous system. It is due to defective intracellular processing and transport of low-density lipoprotein derived cholesterol. It causes accumulation of cholesterol in lysosomes, with delayed induction of cholesterol homeostatic reactions. Niemann-Pick disease type C1 has a highly variable clinical phenotype. Clinical features include variable hepatosplenomegaly and severe progressive neurological dysfunction such as ataxia, dystonia and dementia. The age of onset can vary from infancy to late adulthood. An allelic variant of Niemann-Pick disease type C1 is found in people with Nova Scotia ancestry. Patients with the Nova Scotian clinical variant are less severely affected. {ECO:0000269PubMed:10480349, ECO:0000269PubMed:10521290, ECO:0000269PubMed:10521297, ECO:0000269PubMed:11182931, ECO:0000269PubMed:11333381, ECO:0000269PubMed:11349231, ECO:0000269PubMed:11479732, ECO:0000269PubMed:11545687, ECO:0000269PubMed:11754101, ECO:0000269PubMed:12401890, ECO:0000269PubMed:12408188, ECO:0000269PubMed:12554680, ECO:0000269PubMed:12955717, ECO:0000269PubMed:15774455, ECO:0000269PubMed:16098014, ECO:0000269PubMed:16126423, ECO:0000269PubMed:16802107, ECO:0000269PubMed:9211849, ECO:0000269PubMed:9634529}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 17 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000731
Sterol-sensing domain IPR003392 Patched IPR004765 Niemann-Pick C type protein IPR004869 Membrane transport protein, MMPL domain |
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PFAM |
PF02460
PF03176 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O15118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O15118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 4864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.715623 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_000262 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:7897 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 607623 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11878 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 09622 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF002020 AF157365 AF157366 AF157367 AF157368 AF157369 AF157370 AF157371 AF157372 AF157373 AF157374 AF157375 AF157376 AF157377 AF157378 AF157379 AF338230 AH009108 BC063302 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB63982 AAD48006 AAF28875 AAH63302 AAK25791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||