Mus musculus Protein: Gtpbp1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-162391.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Gtpbp1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | GTP binding protein 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AL022987; AW045683; C85212; GP-1; Gtpbp; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000043575 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-162385 (Gtpbp1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Promotes degradation of target mRNA species. Plays a role in the regulation of circadian mRNA stability. Binds GTP and has GTPase activity (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:10938096}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Detected in some neurons in the brain cortex. Detected in small arteries, dendritic cells and macrophages in the thymus. Detected in lung bronchi, in bronchial epithelial cells and in bronchial smooth muscle cells. Detected in smooth muscle cells in a broad range of organs (at protein level). Expressed in brain, thymus, lung, and kidney. {ECO:0000269PubMed:10938096, ECO:0000269PubMed:9070279}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:109443 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000795
Elongation factor, GTP-binding domain IPR004160 Translation elongation factor EFTu/EF1A, C-terminal IPR004161 Translation elongation factor EFTu/EF1A, domain 2 IPR009000 Translation protein, beta-barrel domain IPR009001 Translation elongation factor EF1A/initiation factor IF2gamma, C-terminal IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00009
PF03143 PF03144 |
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PRINTS |
PR00315
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O08582 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O08582 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 14904 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.19080 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_038846 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | 1KJ3 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Gtpbp1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27648 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK004612 AK147717 AK150068 AK150185 AK170091 BC046228 U87965 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB51274 AAH46228 BAB23409 BAE28091 BAE29280 BAE29365 BAE41557 | ||||||||||||||||||||||