Mus musculus Protein: Spata13 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-170682.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | Spata13 | ||||||||||||||||||
Protein Name | spermatogenesis associated 13 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000022566 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-170680 (Spata13) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Acts as guanine nucleotide exchange factor (GEF) for RHOA, RAC1 and CDC42 GTPases. Regulates cell migration and adhesion assembly and disassembly through a RAC1, PI3K, RHOA and AKT1-dependent mechanism. Increases both RAC1 and CDC42 activity, but decreases the amount of active RHOA (By similarity). Required for MMP9 up-regulation via the JNK signaling pathway in colorectal tumor cells. Involved in tumor angiogenesis and may play a role in intestinal adenoma formation and tumor progression. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:19893577}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. Cell projection, filopodium {ECO:0000250}. Cell projection, lamellipodium {ECO:0000250}. Cell projection, ruffle membrane {ECO:0000250}. Note=Accumulates in the lamellipodium and ruffle membrane in response to hepatocyte growth factor (HGF) treatment. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expression is aberrantly enhanced in most colorectal tumors. {ECO:0000269PubMed:19893577}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:104838 | ||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000219
Dbl homology (DH) domain IPR001452 SH3 domain IPR001849 Pleckstrin homology domain IPR011511 Variant SH3 domain |
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PFAM |
PF00621
PF00018 PF14604 PF00169 PF07653 |
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PRINTS |
PR00452
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PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00325
SM00326 SM00233 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q5DU57 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q5DU57 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | E9Q3I3 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 219140 | ||||||||||||||||||
UniGene | Mm.404006 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001028444 | ||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||
MGI Symbol | Spata13 | ||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS49516 | ||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AC114000 AC151835 AK158193 AK220313 | ||||||||||||||||||
GenPept | BAD90389 BAE34401 | ||||||||||||||||||