Mus musculus Protein: Plxnd1 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-179968.7 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Plxnd1 | ||||||||||||||||||||||||
Protein Name | plexin D1 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 6230425C21Rik; b2b1863Clo; b2b553Clo; | ||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000015511 | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-179964 (Plxnd1) | ||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||
Function | Cell surface receptor for SEMA4A and for class 3 semaphorins, such as SEMA3A, SEMA3C and SEMA3E. Plays an important role in cell-cell signaling, and in regulating the migration of a wide spectrum of cell types. Regulates the migration of thymocytes in the medulla. Regulates endothelial cell migration. Plays an important role in ensuring the specificity of synapse formation. Mediates anti-angiogenic signaling in response to SEMA3E. Required for normal development of the heart and vasculature. {ECO:0000269PubMed:15239958, ECO:0000269PubMed:17318185, ECO:0000269PubMed:18992737, ECO:0000269PubMed:19027330, ECO:0000269PubMed:19421194, ECO:0000269PubMed:22179111}. | ||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane {ECO:0000269PubMed:17318185, ECO:0000269PubMed:19027330}; Single-pass membrane protein {ECO:0000269PubMed:17318185, ECO:0000269PubMed:19027330}. | ||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Detected in embryonic heart and vascular endothelium, brain, dorsal root ganglia, adrenal gland, lung mesenchyme, small intestine and in the ossification centers of vertebral bodies. {ECO:0000269PubMed:18992737}. | ||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:2154244 | ||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001627
Sema domain IPR002165 Plexin IPR002909 IPT domain IPR008936 Rho GTPase activation protein IPR013548 Plexin, cytoplasmic RasGAP domain IPR014756 Immunoglobulin E-set IPR016201 Plexin-like fold |
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PFAM |
PF01403
PF01437 PF01833 PF08337 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00630
SM00429 SM00423 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q3UH93 | ||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q3UH93 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8VCL8 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 67784 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.3085 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_080652 | ||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Plxnd1 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20448 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC139761 AK129175 AK147513 AY688678 BC019530 CH466523 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH19530 AAT99561 BAC97985 BAE27964 EDK99549 | ||||||||||||||||||||||||