Mus musculus Protein: Top3a | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-181699.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Top3a | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | topoisomerase (DNA) III alpha | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000002891 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-181695 (Top3a) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Releases the supercoiling and torsional tension of DNA introduced during the DNA replication and transcription by transiently cleaving and rejoining one strand of the DNA duplex. Introduces a single-strand break via transesterification at a target site in duplex DNA. The scissile phosphodiester is attacked by the catalytic tyrosine of the enzyme, resulting in the formation of a DNA-(5'-phosphotyrosyl)-enzyme intermediate and the expulsion of a 3'-OH DNA strand. The free DNA strand then undergoes passage around the unbroken strand thus removing DNA supercoils. Finally, in the religation step, the DNA 3'-OH attacks the covalent intermediate to expel the active-site tyrosine and restore the DNA phosphodiester backbone. Essential component of the RMI complex, a complex that plays an important role in the processing of homologous recombination intermediates to limit DNA crossover formation in cells. Has DNA decatenation activity (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | |||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Highly expressed in testis. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 15 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1197527 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000380
DNA topoisomerase, type IA IPR001878 Zinc finger, CCHC-type IPR003601 DNA topoisomerase, type IA, domain 2 IPR003602 DNA topoisomerase, type IA, DNA-binding IPR006171 Toprim domain IPR010666 Zinc finger, GRF-type IPR013497 DNA topoisomerase, type IA, central IPR013498 DNA topoisomerase, type IA, zn finger IPR023405 DNA topoisomerase, type IA, core domain |
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PFAM |
PF00098
PF01751 PF13662 PF06839 PF01131 PF01396 |
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PRINTS |
PR00417
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00343
SM00436 SM00437 SM00493 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O70157 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O70157 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q924H1 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 21975 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.477819 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_033436 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Top3a | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24797 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB006074 AF330011 BC099689 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH99689 AAK61334 BAA25662 | ||||||||||||||||||||||