Mus musculus Protein: Neurod1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-183355.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Neurod1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | neurogenic differentiation 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BETA2; BHF-1; bHLHa3; Neurod; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000040364 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-183353 (Neurod1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Acts as a transcriptional activator: mediates transcriptional activation by binding to E box-containing promoter consensus core sequences 5'-CANNTG-3'. Associates with the p300/CBP transcription coactivator complex to stimulate transcription of the secretin gene as well as the gene encoding the cyclin-dependent kinase inhibitor CDKN1A. Contributes to the regulation of several cell differentiation pathways, like those that promote the formation of early retinal ganglion cells, inner ear sensory neurons, granule cells forming either the cerebellum or the dentate gyrus cell layer of the hippocampus, endocrine islet cells of the pancreas and enteroendocrine cells of the small intestine. Together with PAX6 or SIX3, is required for the regulation of amacrine cell fate specification. Also required for dendrite morphogenesis and maintenance in the cerebellar cortex. Associates with chromatin to enhancer regulatory elements in genes encoding key transcriptional regulators of neurogenesis. {ECO:0000269PubMed:10398678, ECO:0000269PubMed:10639171, ECO:0000269PubMed:11152640, ECO:0000269PubMed:11861467, ECO:0000269PubMed:11970861, ECO:0000269PubMed:12810726, ECO:0000269PubMed:14697366, ECO:0000269PubMed:15797719, ECO:0000269PubMed:18007592, ECO:0000269PubMed:18339630, ECO:0000269PubMed:19200230, ECO:0000269PubMed:19759004, ECO:0000269PubMed:21593321, ECO:0000269PubMed:9308961, ECO:0000269PubMed:9512516}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. Nucleus {ECO:0000255PROSITE-ProRule:PRU00981}. Note=In pancreatic islet cells, shuttles to the nucleus in response to glucose stimulation. Colocalizes with NR0B2 in the nucleus (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in pancreatic beta cells, pulmonary neuroendocrine cells and retinal interneurons amacrine cells (at protein level). Expressed in endocrine cells of the pancreas. Expressed in the inner layer of cerebellar external granular layer (EGL). Expressed in the Ammon's horn (AH), which includes the CA1- CA3 pyramidal layer and in granule cells of the dentate gyrus (DG). Expressed in photoreceptors of the outer nuclear layer (ONL), in a subset of cells in the lower half of the inner nuclear layer (INL), and in a subset of cells in the ganglion cell layer (GCL) of the retina. Expressed in cholinergic and AII amacrine cell types. Expressed in differentiating neurons of both the central and peripheral nervous systems. {ECO:0000269PubMed:10398678, ECO:0000269PubMed:11861467, ECO:0000269PubMed:12810726, ECO:0000269PubMed:14752053, ECO:0000269PubMed:19759004, ECO:0000269PubMed:9308961}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1339708 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR011598
Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain IPR016637 Transcription factor, basic helix-loop-helix, NeuroD IPR022575 Neurogenic differentiation factor, domain of unknown function |
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PFAM |
PF00010
PF12533 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF015618
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SMART |
SM00353
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q60867 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q60867 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 18012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.470897 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_035024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | 2QL2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Neurod1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS16169 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK005073 AK018781 BC018241 U28068 U28888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC52203 AAC52204 AAH18241 BAB23797 BAB31405 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||