Homo sapiens Protein: KDM4B | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-19713.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | KDM4B | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | lysine (K)-specific demethylase 4B | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | JMJD2B; TDRD14B; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000159111 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-19711 (KDM4B) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Histone demethylase that specifically demethylates 'Lys- 9' of histone H3, thereby playing a role in histone code. Does not demethylate histone H3 'Lys-4', H3 'Lys-27', H3 'Lys-36' nor H4 'Lys-20'. Only able to demethylate trimethylated H3 'Lys-9', with a weaker activity than KDM4A, KDM4C and KDM4D. Demethylation of Lys residue generates formaldehyde and succinate. {ECO:0000269PubMed:16603238}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00537, ECO:0000269PubMed:15927959}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 20 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001965
Zinc finger, PHD-type IPR002999 Tudor domain IPR003347 JmjC domain IPR003349 Transcription factor jumonji, JmjN IPR011011 Zinc finger, FYVE/PHD-type |
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PFAM |
PF00567
PF02373 PF08007 PF02375 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00249
SM00333 SM00558 SM00545 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O94953 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O94953 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | K7ES23 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 23030 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.735448 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_055830 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:29136 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 609765 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12138 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 11056 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB020683 AC005595 AC022517 AC053467 AC093033 AC104520 AK126854 AL133622 BC063889 BC136611 CH471139 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC33799 AAF31271 AAH63889 AAI36612 BAA74899 BAG54381 CAB63748 EAW69181 EAW69183 | ||||||||||||||||||||||