Mus musculus Protein: Cpsf3l | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-208048.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cpsf3l | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | cleavage and polyadenylation specific factor 3-like | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2410006F12Rik; AU044035; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000030901 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-208046 (Cpsf3l) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Catalytic component of the Integrator complex, a complex involved in the small nuclear RNAs (snRNA) U1 and U2 transcription and in their 3'-box-dependent processing. The Integrator complex is associated with the C-terminal domain (CTD) of RNA polymerase II largest subunit (POLR2A) and is recruited to the U1 and U2 snRNAs genes. Mediates the snRNAs 3' cleavage (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Cytoplasm {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 18 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1919207 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001279
Beta-lactamase-like IPR011108 RNA-metabolising metallo-beta-lactamase IPR022712 Beta-Casp domain |
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PFAM |
PF00753
PF07521 PF10996 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00849
SM01027 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9CWS4 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9CWS4 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 71957 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.475640 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_082296 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Cpsf3l | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19048 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK010425 AK090206 AK150436 AK152740 AK167607 AK172533 BC008240 BC011155 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH08240 AAH11155 BAB26928 BAC41135 BAE29558 BAE31460 BAE39661 BAE43054 | ||||||||||||||||||||||