Homo sapiens Protein: DDX60 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-242995.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | DDX60 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000377344 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-43861 (DDX60) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Positively regulates DDX58/RIG-I- and IFIH1/MDA5- dependent type I interferon and interferon inducible gene expression in response to viral infection. Binds ssRNA, dsRNA and dsDNA and can promote the binding of DDX58/RIG-I to dsRNA. Exhibits antiviral activity against hepatitis C virus and vesicular stomatitis virus (VSV). {ECO:0000269PubMed:21478870, ECO:0000269PubMed:21791617}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:21791617}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Brain, lymph node, prostate, stomach, thyroid, tongue, trachea, uterus, skeletal muscle, spleen, kidney, liver and small intestine. {ECO:0000269PubMed:21791617}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001650
Helicase, C-terminal IPR006935 Helicase/UvrB domain IPR011545 DEAD/DEAH box helicase domain IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00271
PF04851 PF00270 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00490
SM00487 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8IY21 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8IY21 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9NXV7 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 55601 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.591710 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_060101 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:25942 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 613974 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34097 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 07877 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC068989 AC093888 AK000042 AK001649 AK026333 BC007820 BC020601 BC038115 BC074781 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH07820 AAH20601 AAH38115 AAH74781 BAA90901 BAA91809 BAB15451 | ||||||||||||||||||||||