Homo sapiens Protein: RFXANK | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-245888.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RFXANK | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | regulatory factor X-associated ankyrin-containing protein | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | ANKRA1; BLS; F14150_1; RFX-B; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000376138 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-39533 (RFXANK) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Activates transcription from class II MHC promoters. Activation requires the activity of the MHC class II transactivator (MHC2TA). May regulate other genes in the cell. RFX binds the X1 box of MHC-II promoters. Isoform RFX-B-delta5 is not involved in the positive regulation of MHC class II genes. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Bare lymphocyte syndrome 2 (BLS2) [MIM:209920]: A severe combined immunodeficiency disease with early onset. It is characterized by a profound defect in constitutive and interferon- gamma induced MHC II expression, absence of cellular and humoral T-cell response to antigen challenge, hypogammaglobulinemia and impaired antibody production. The consequence include extreme susceptibility to viral, bacterial and fungal infections. {ECO:0000269PubMed:10072068, ECO:0000269PubMed:10725724, ECO:0000269PubMed:9806546}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitous. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 25 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002110
Ankyrin repeat IPR017362 DNA-binding, RFXANK IPR020683 Ankyrin repeat-containing domain |
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PFAM |
PF00023
PF13606 PF11929 PF12796 |
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PRINTS |
PR01415
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PIRSF |
PIRSF038034
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SMART |
SM00248
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O14593 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O14593 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A0A024R7P0 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 8625 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_604389 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9987 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 603200 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12396 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 04435 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC002126 AC003110 AF077196 AF094760 AF105427 AF105428 BC114558 BC114563 CH471106 CR542199 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB86654 AAC69883 AAD17972 AAD17973 AAD26991 AAI14559 AAI14564 CAG46996 EAW84795 EAW84798 EAW84799 | ||||||||||||||||||||||