Mus musculus Protein: Lsm2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-252690.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Lsm2 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | LSM2 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | D17H6S56E-2; D17H6S56E2; Dmapl; Dmpkap; G7b; Sm-X5; SmX5; snRNP; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000109644 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-175385 (Lsm2) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Binds specifically to the 3'-terminal U-tract of U6 snRNA. May be involved in pre-mRNA splicing (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 45 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:90676 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001163
Ribonucleoprotein LSM domain IPR006649 Ribonucleoprotein LSM domain, eukaryotic/archaea-type IPR010920 Like-Sm (LSM) domain IPR016654 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2 |
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PFAM |
PF01423
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF016394
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SMART |
SM00651
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O35900 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O35900 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3U9X2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 27756 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.415967 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001191203 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Lsm2 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS50081 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF397035 AF397036 AK151605 BC014288 CH466666 U85207 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB72037 AAH14288 AAL14450 AAL14458 BAE30544 EDL26704 | ||||||||||||||||||||||