Mus musculus Protein: Ddx39 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-261589.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ddx39 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 39 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2610307C23Rik; BAT1; Ddx39a; DDXL; URH49; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000105435 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-172499 (Ddx39) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Involved in pre-mRNA splicing. Required for the export of mRNA out of the nucleus (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Cytoplasm {ECO:0000250}. Note=Can translocate to the cytoplasm in the presence of MX1. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 15 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1915528 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001650
Helicase, C-terminal IPR011545 DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR014014 RNA helicase, DEAD-box type, Q motif IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00271
PF00270 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00490
SM00487 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8VDW0 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8VDW0 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 68278 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.28222 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | XP_006531395 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ddx39 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22460 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK088894 AK145927 AK146294 AK150997 AK162752 AK168079 BC020134 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH20134 BAC40637 BAE26758 BAE27051 BAE30021 BAE37049 BAE40052 | ||||||||||||||||||||||