Mus musculus Protein: Coro1a | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-268914.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Coro1a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | coronin, actin binding protein 1A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Clabp; Lmb3; p57; TACO; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000101972 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-209756 (Coro1a) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | May be a crucial component of the cytoskeleton of highly motile cells, functioning both in the invagination of large pieces of plasma membrane, as well as in forming protrusions of the plasma membrane involved in cell locomotion. In mycobacteria- infected cells, its retention on the phagosomal membrane prevents fusion between phagosomes and lysosomes. {ECO:0000269PubMed:10338208}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, cytoskeleton {ECO:0000269PubMed:10338208}. Cytoplasm, cell cortex {ECO:0000269PubMed:10338208}. Cytoplasmic vesicle, phagosome membrane {ECO:0000269PubMed:10338208}. Note=In non-infected macrophages, associated with the cortical microtubule network. In mycobacteria-infected macrophages, becomes progressively relocalized and retained around the mycobacterial phagosomes. Retention on the phagosomal membrane is strictly dependent on mycobacterial viability and not due to impaired acidification. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in spleen, lymph nodes, thymus, brain and at very lower levels in lung. Also expressed in cells of the lymphoid/myeloid lineage. Not expressed in Kuffper cells. {ECO:0000269PubMed:10338208}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 16 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1345961 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001680
WD40 repeat IPR015048 Domain of unknown function DUF1899 IPR015049 Domain of unknown function DUF1900 IPR017986 WD40-repeat-containing domain |
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PFAM |
PF00400
PF08953 PF08954 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00320
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O89053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O89053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3U1N0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12721 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.290482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XP_006507349 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | 2B4E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Coro1a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS21840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC124505 AF047388 AF143955 AF495468 AK146290 AK155860 AK165296 BC002136 BC053398 U89399 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC36506 AAD31082 AAD32703 AAH02136 AAH53398 AAM18514 BAE27047 BAE33465 BAE38125 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||