Version 5.4
| Homo sapiens Protein: CWC22 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-293398.5 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | CWC22 | ||||||||||||||||||
| Protein Name | CWC22 spliceosome-associated protein homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSP00000387006 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-76644 (CWC22) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | Required for pre-mRNA splicing and for exon-junction complex (EJC) assembly. Hinders EIF4A3 from non-specifically binding RNA and escorts it to the splicing machinery to promote EJC assembly on mature mRNAs. Through its role in EJC assembly, required for nonsense-mediated mRNA decay. {ECO:0000269PubMed:22959432, ECO:0000269PubMed:22961380, ECO:0000269PubMed:23236153}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Nucleus. Nucleus speckle. Note=Concentrates around speckles, which are sites of pre-mRNA synthesis and processing, where it colocalizes with EJC core proteins. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 20 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR003890
MIF4G-like, type 3 IPR003891 Initiation factor eIF-4 gamma, MA3 IPR016024 Armadillo-type fold |
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| PFAM |
PF02854
PF02847 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00543
SM00544 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q9HCG8 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q9HCG8 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | B7WP74 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 57703 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.614681 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_065994 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:29322 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 615186 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS46465 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 17220 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AB046824 AC068194 AC096587 AK025635 AK026978 BC016651 BC031216 BC053573 BC057826 BC093952 BC093954 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAH16651 AAH31216 AAH53573 AAH57826 AAH93952 AAH93954 BAB13430 BAB15197 BAB15612 | ||||||||||||||||||