Mus musculus Protein: Lmna | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-401142.4 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Lmna | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | lamin A | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Dhe; | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000113093 | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-160992 (Lmna) | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Function | Lamins are components of the nuclear lamina, a fibrous layer on the nucleoplasmic side of the inner nuclear membrane, which is thought to provide a framework for the nuclear envelope and may also interact with chromatin. Lamin A and C are present in equal amounts in the lamina of mammals. Plays an important role in nuclear assembly, chromatin organization, nuclear membrane and telomere dynamics. Required for normal development of peripheral nervous system and skeletal muscle and for muscle satellite cell proliferation. Required for osteoblastogenesis and bone formation. Also prevents fat infiltration of muscle and bone marrow, helping to maintain the volume and strength of skeletal muscle and bone. Isoform C2 may have a role in determining the organization of nuclear and chromosomal structures during spermatogenesis. {ECO:0000269PubMed:10579712, ECO:0000269PubMed:11799477, ECO:0000269PubMed:19124654, ECO:0000269PubMed:21547077, ECO:0000269PubMed:21982926, ECO:0000269PubMed:23535822}.Prelamin-A/C can accelerate smooth muscle cell senescence. It acts to disrupt mitosis and induce DNA damage in vascular smooth muscle cells (VSMCs), leading to mitotic failure, genomic instability, and premature senescence (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Nucleus envelope. Nucleus lamina {ECO:0000250}. Nucleus, nucleoplasm {ECO:0000250}. Note=Farnesylation of prelamin-A/C facilitates nuclear envelope targeting and subsequent cleaveage by ZMPSTE24/FACE1 to remove the farnesyl group produces mature lamin-A/C, which can then be inserted into the nuclear lamina. EMD is required for proper localization of non-farnesylated prelamin-A/C (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in liver and in bone marrow (at protein level). Isoform C2 is specifically expressed in germ cells. {ECO:0000269PubMed:10579712, ECO:0000269PubMed:21547077}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 69 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 71 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:96794 | ||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001322
Lamin Tail Domain IPR001664 Intermediate filament protein IPR009053 Prefoldin |
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PFAM |
PF00932
PF00038 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P48678 | ||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P48678 | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9CTL2 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 16905 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.488848 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001104572 | ||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | 1UFG | ||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Lmna | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS50951 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC102388 AC145168 AK003174 AK004619 AK147150 AK149998 AK150391 AK150501 AK150624 AK152539 AK152646 AK152846 AK161221 AK167858 BC015302 BC094020 CH466547 D13181 D14850 D49733 DQ832702 DQ832703 X14170 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH15302 AAH94020 ABI16251 ABI16252 BAA02476 BAA03578 BAA08569 BAA08570 BAA08571 BAB22619 BAB23415 BAE27717 BAE29226 BAE29519 BAE29614 BAE29714 BAE31294 BAE31384 BAE31539 BAE36246 BAE39876 CAA32372 EDL15275 | ||||||||||||||||||||||||||||