Homo sapiens Protein: MATR3 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-474459.4 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | MATR3 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | matrin 3 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | ALS21; MPD2; VCPDM; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000423533 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-47535 (MATR3) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure |
![]() |
||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | May play a role in transcription or may interact with other nuclear matrix proteins to form the internal fibrogranular network. In association with the SFPQ-NONO heteromer may play a role in nuclear retention of defective RNAs. {ECO:0000269PubMed:11525732}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus matrix. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Amyotrophic lateral sclerosis 21 (ALS21) [MIM:606070]: A neurodegenerative disorder affecting upper and lower motor neurons, resulting in muscle weakness and respiratory failure. Some patients may develop myopathic features or dementia. {ECO:0000269PubMed:19344878, ECO:0000269PubMed:24686783}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 80 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR000690 Zinc finger, C2H2-type matrin IPR003604 Zinc finger, U1-type |
||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00076
|
||||||||||||||||||||||
PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
SM00451 |
||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P43243 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P43243 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9H4N1 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9782 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.602545 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6912 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 164015 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4210 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 05270 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB018266 AC011404 AF117236 AK001388 AK316420 AY007157 BC015031 CH471062 M63483 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF17217 AAG02007 AAH15031 BAA34443 BAG50899 BAH14791 EAW62114 EAW62115 EAW62116 EAW62117 | ||||||||||||||||||||||