Homo sapiens Protein: BRCA1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-483754.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BRCA1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | breast cancer 1, early onset | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BRCAI; BRCC1; BROVCA1; IRIS; PNCA4; PPP1R53; PSCP; RNF53; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000417148 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-52172 (BRCA1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | E3 ubiquitin-protein ligase that specifically mediates the formation of 'Lys-6'-linked polyubiquitin chains and plays a central role in DNA repair by facilitating cellular responses to DNA damage. It is unclear whether it also mediates the formation of other types of polyubiquitin chains. The E3 ubiquitin-protein ligase activity is required for its tumor suppressor function. The BRCA1-BARD1 heterodimer coordinates a diverse range of cellular pathways such as DNA damage repair, ubiquitination and transcriptional regulation to maintain genomic stability. Regulates centrosomal microtubule nucleation. Required for normal cell cycle progression from G2 to mitosis. Required for appropriate cell cycle arrests after ionizing irradiation in both the S-phase and the G2 phase of the cell cycle. Involved in transcriptional regulation of P21 in response to DNA damage. Required for FANCD2 targeting to sites of DNA damage. May function as a transcriptional regulator. Inhibits lipid synthesis by binding to inactive phosphorylated ACACA and preventing its dephosphorylation. Contributes to homologous recombination repair (HRR) via its direct interaction with PALB2, fine-tunes recombinational repair partly through its modulatory role in the PALB2-dependent loading of BRCA2-RAD51 repair machinery at DNA breaks. Component of the BRCA1-RBBP8 complex which regulates CHEK1 activation and controls cell cycle G2/M checkpoints on DNA damage via BRCA1-mediated ubiquitination of RBBP8. {ECO:0000269PubMed:10500182, ECO:0000269PubMed:10724175, ECO:0000269PubMed:11836499, ECO:0000269PubMed:12887909, ECO:0000269PubMed:12890688, ECO:0000269PubMed:14976165, ECO:0000269PubMed:14990569, ECO:0000269PubMed:16326698, ECO:0000269PubMed:16818604, ECO:0000269PubMed:17525340, ECO:0000269PubMed:18056443, ECO:0000269PubMed:19261748, ECO:0000269PubMed:19369211, ECO:0000269PubMed:20351172, ECO:0000269PubMed:20364141}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:15133502, ECO:0000269PubMed:17525340, ECO:0000269PubMed:21144835, ECO:0000269PubMed:9528852}. Chromosome {ECO:0000250}. Note=Localizes at sites of DNA damage at double-strand breaks (DSBs); recruitment to DNA damage sites is mediated by the BRCA1-A complex.Isoform 3: Cytoplasm.Isoform 5: Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:8972225}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Breast cancer (BC) [MIM:114480]: A common malignancy originating from breast epithelial tissue. Breast neoplasms can be distinguished by their histologic pattern. Invasive ductal carcinoma is by far the most common type. Breast cancer is etiologically and genetically heterogeneous. Important genetic factors have been indicated by familial occurrence and bilateral involvement. Mutations at more than one locus can be involved in different families or even in the same case. {ECO:0000269PubMed:10323242, ECO:0000269PubMed:12442275, ECO:0000269PubMed:12938098, ECO:0000269PubMed:14722926, ECO:0000269PubMed:18285836, ECO:0000269PubMed:7545954, ECO:0000269PubMed:7894491, ECO:0000269PubMed:7894493, ECO:0000269PubMed:7939630, ECO:0000269PubMed:8554067, ECO:0000269PubMed:8723683, ECO:0000269PubMed:8776600, ECO:0000269PubMed:9482581, ECO:0000269PubMed:9609997, ECO:0000269PubMed:9760198}. Note=Disease susceptibility is associated with variations affecting the gene represented in this entry. Mutations in BRCA1 are thought to be responsible for 45% of inherited breast cancer. Moreover, BRCA1 carriers have a 4-fold increased risk of colon cancer, whereas male carriers face a 3- fold increased risk of prostate cancer. Cells lacking BRCA1 show defects in DNA repair by homologous recombination.Breast-ovarian cancer, familial, 1 (BROVCA1) [MIM:604370]: A condition associated with familial predisposition to cancer of the breast and ovaries. Characteristic features in affected families are an early age of onset of breast cancer (often before age 50), increased chance of bilateral cancers (cancer that develop in both breasts, or both ovaries, independently), frequent occurrence of breast cancer among men, increased incidence of tumors of other specific organs, such as the prostate. {ECO:0000269PubMed:12938098, ECO:0000269PubMed:14722926, ECO:0000269PubMed:8968716}. Note=Disease susceptibility is associated with variations affecting the gene represented in this entry. Mutations in BRCA1 are thought to be responsible for more than 80% of inherited breast-ovarian cancer.Ovarian cancer (OC) [MIM:167000]: The term ovarian cancer defines malignancies originating from ovarian tissue. Although many histologic types of ovarian tumors have been described, epithelial ovarian carcinoma is the most common form. Ovarian cancers are often asymptomatic and the recognized signs and symptoms, even of late-stage disease, are vague. Consequently, most patients are diagnosed with advanced disease. {ECO:0000269PubMed:10196379, ECO:0000269PubMed:10486320, ECO:0000269PubMed:14746861}. Note=Disease susceptibility is associated with variations affecting the gene represented in this entry.Pancreatic cancer 4 (PNCA4) [MIM:614320]: A malignant neoplasm of the pancreas. Tumors can arise from both the exocrine and endocrine portions of the pancreas, but 95% of them develop from the exocrine portion, including the ductal epithelium, acinar cells, connective tissue, and lymphatic tissue. {ECO:0000269PubMed:18762988}. Note=Disease susceptibility is associated with variations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Isoform 1 and isoform 3 are widely expressed. Isoform 3 is reduced or absent in several breast and ovarian cancer cell lines. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 625 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001357
BRCT domain IPR001841 Zinc finger, RING-type IPR011364 Breast cancer type 1 susceptibility protein (BRCA1) IPR018957 Zinc finger, C3HC4 RING-type |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00533
PF12738 PF13639 PF14634 PF00097 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR00493
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF001734
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00292
SM00184 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P38398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P38398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9UE29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 672 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.622171 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_009230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1100 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 113705 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00218 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB621825 AC060780 AC135721 AF005068 AF284812 AF507076 AF507078 AY093485 AY093486 AY093487 AY093489 AY093490 AY093493 AY273801 BC072418 DQ190450 DQ190451 DQ190452 DQ190453 DQ190454 DQ190455 DQ190456 FJ940752 JX480462 L78833 U14680 U37574 U61268 U64805 Y08757 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA73985 AAB40910 AAB61673 AAC00049 AAC37594 AAC50330 AAF97939 AAH72418 AAM18219 AAM18220 AAM18221 AAM18222 AAM18223 AAM18226 AAN61423 AAN61425 AAP12647 ABA29208 ABA29211 ABA29214 ABA29217 ABA29220 ABA29223 ABA29226 ACR33809 AFU88804 BAK64160 CAA70003 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||