Homo sapiens Protein: RAB20 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-50736.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | RAB20 | ||||||||||||||||||
Protein Name | RAB20, member RAS oncogene family | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000267328 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-50734 (RAB20) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Plays a role in apical endocytosis/recycling. Plays a role in the maturation and acidification of phagosomes that engulf pathogens, such as S.aureus and M.tuberculosis. Plays a role in the fusion of phagosomes with lysosomes. {ECO:0000269PubMed:21255211}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Golgi apparatus. Cytoplasmic vesicle, phagosome. Cytoplasmic vesicle, phagosome membrane {ECO:0000250}; Lipid-anchor {ECO:0000250}; Cytoplasmic side {ECO:0000250}. Note=Highly enriched on apical endocytic structures in polarized epithelial cells of kidney proximal tubules (By similarity). Recruited to phagosomes containing S.aureus or M.tuberculosis. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Low or absent expression in normal pancreas and stronger expression in 15 of 18 exocrine pancreatic adenocarcinomas (at protein level). {ECO:0000269PubMed:16613320}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001806
Small GTPase superfamily IPR003578 Small GTPase superfamily, Rho type IPR003579 Small GTPase superfamily, Rab type IPR005225 Small GTP-binding protein domain IPR006689 Small GTPase superfamily, ARF/SAR type IPR013684 Mitochondrial Rho-like IPR020849 Small GTPase superfamily, Ras type IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00071
PF00025 PF08477 |
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PRINTS |
PR00449
PR00328 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00174
SM00175 SM00173 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q9NX57 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9NX57 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 55647 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.743563 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_060287 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:18260 | ||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS9512 | ||||||||||||||||||
HPRD | 06694 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AJ272065 AK000436 AK000446 AL139385 BC026025 CH471085 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAH26025 BAA91163 BAA91171 CAC81247 CAI17006 EAX09113 | ||||||||||||||||||