Version 5.4
| Mus musculus Protein: Zcchc11 | |||||||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-533801.4 | ||||||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | Zcchc11 | ||||||||||||||||||||||
| Protein Name | zinc finger, CCHC domain containing 11 | ||||||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||||||
| Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSMUSP00000120172 | ||||||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-172864 (Zcchc11) | ||||||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
| Function | Uridylyltransferase that acts as a suppressor of microRNA (miRNA) biogenesis by specifically mediating the terminal uridylation of some miRNAs. Catalyzes the 3' uridylation of precursor let-7 (pre-let-7), a miRNA precursor. Uridylated pre- let-7 miRNAs fail to be processed by Dicer and undergo degradation. Degradation of pre-let-7 contributes to the maintenance of embryonic stem (ES) cells and is required for ES cells to maintain pluripotency. Does not bind RNA by itself, recruited to pre-let-7 miRNAs via its interaction with LIN28A and LIN28B (By similarity). Also catalyzes the 3' uridylation of miR- 26A, a miRNA that represses IL6 transcript, leading to abrogate IL6 transcript repression and promote cytokine expression. May also suppress Toll-like receptor-induced NF-kappa-B activity via binding to T2BP. Does not play a role in replication-dependent histone mRNA degradation (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Cytoplasm {ECO:0000250}. Note=Translocates into the cytoplasm following treatment of the cell with LPS. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | Ubiquitously expressed. {ECO:0000269PubMed:19701194}. | ||||||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 10 interaction(s) predicted by orthology.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
| PDB ID | MGI:2445126 | ||||||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR001878
Zinc finger, CCHC-type IPR002058 PAP/25A-associated |
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| PFAM |
PF00098
PF03828 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||||||
| SMART |
SM00343
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-B2RX14 | ||||||||||||||||||||||
| TrEMBL | Q8BIZ5 | ||||||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 230594 | ||||||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.416791 | ||||||||||||||||||||||
| RefSeq | |||||||||||||||||||||||
| MGI ID | |||||||||||||||||||||||
| MGI Symbol | Zcchc11 | ||||||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||||||
| CCDS | |||||||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||||||
| EMBL | AK049279 | ||||||||||||||||||||||
| GenPept | BAC33655 | ||||||||||||||||||||||