Mus musculus Protein: Zfr | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-539676.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Zfr | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | zinc finger RNA binding protein | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | C920030H05Rik; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000118911 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-129771 (Zfr) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Involved in postimplantation and gastrulation stages of development. Binds to DNA and RNA. Involved in the nucleocytoplasmic shuttling of STAU2 (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Cytoplasm. Cytoplasmic granule {ECO:0000250}. Chromosome {ECO:0000250}. Note=Associated with chromosome foci in meiotic cells. Localizes in somatodendritic compartment of primary hippocampal neurons (By similarity). Colocalizes with STAU2 in several cytosolic RNA granules (By similarity). Associated with chromosomes. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in Sertoli cells, spermatocytes, primary and growing oocytes and granulosa cells (at protein level). Expressed in testis, ovary and brain. {ECO:0000269PubMed:10072773, ECO:0000269PubMed:11283266}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 31 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1341890 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003604
Zinc finger, U1-type IPR006561 DZF IPR015880 Zinc finger, C2H2-like IPR022755 Zinc finger, double-stranded RNA binding |
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PFAM |
PF07528
PF12171 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00451
SM00572 SM00355 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O88532 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O88532 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B2RUG7 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 22763 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.484759 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_035897 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Zfr | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37044 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF071059 AK011329 AK034963 AK158938 BC006962 BC038599 BC058570 BC141139 CH466581 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC25762 AAH06962 AAH38599 AAH58570 AAI41140 BAB27548 BAC28897 BAE34733 EDL03272 | ||||||||||||||||||||||