Homo sapiens Protein: COL1A1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-58240.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | COL1A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | collagen, type I, alpha 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | OI4; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000225964 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-58238 (COL1A1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Type I collagen is a member of group I collagen (fibrillar forming collagen). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted, extracellular space, extracellular matrix {ECO:0000255PROSITE-ProRule:PRU00793}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Caffey disease (CAFFD) [MIM:114000]: Characterized by an infantile episode of massive subperiosteal new bone formation that typically involves the diaphyses of the long bones, mandible, and clavicles. The involved bones may also appear inflamed, with painful swelling and systemic fever often accompanying the illness. The bone changes usually begin before 5 months of age and resolve before 2 years of age. {ECO:0000269PubMed:15864348}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Ehlers-Danlos syndrome 1 (EDS1) [MIM:130000]: A connective tissue disorder characterized by hyperextensible skin, atrophic cutaneous scars due to tissue fragility and joint hyperlaxity. EDS1 is the severe form of classic Ehlers-Danlos syndrome. {ECO:0000269PubMed:10739762, ECO:0000269PubMed:17211858}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Ehlers-Danlos syndrome 7A (EDS7A) [MIM:130060]: A connective tissue disorder characterized by hyperextensible skin, atrophic cutaneous scars due to tissue fragility and joint hyperlaxity. Marked by bilateral congenital hip dislocation, hyperlaxity of the joints, and recurrent partial dislocations. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Osteogenesis imperfecta 1 (OI1) [MIM:166200]: An autosomal dominant form of osteogenesis imperfecta, a connective tissue disorder characterized by low bone mass, bone fragility and susceptibility to fractures after minimal trauma. Disease severity ranges from very mild forms without fractures to intrauterine fractures and perinatal lethality. Extraskeletal manifestations, which affect a variable number of patients, are dentinogenesis imperfecta, hearing loss, and blue sclerae. OI1 is a non-deforming form with normal height or mild short stature, and no dentinogenesis imperfecta. {ECO:0000269PubMed:1634225, ECO:0000269PubMed:16638323, ECO:0000269PubMed:16705691, ECO:0000269PubMed:16786509, ECO:0000269PubMed:1718984, ECO:0000269PubMed:1737847, ECO:0000269PubMed:17875077, ECO:0000269PubMed:18670065, ECO:0000269PubMed:2794057, ECO:0000269PubMed:3244312, ECO:0000269PubMed:8223589}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Osteogenesis imperfecta 2 (OI2) [MIM:166210]: An autosomal dominant form of osteogenesis imperfecta, a connective tissue disorder characterized by low bone mass, bone fragility and susceptibility to fractures after minimal trauma. Disease severity ranges from very mild forms without fractures to intrauterine fractures and perinatal lethality. Extraskeletal manifestations, which affect a variable number of patients, are dentinogenesis imperfecta, hearing loss, and blue sclerae. OI2 is characterized by bone fragility, with many perinatal fractures, severe bowing of long bones, undermineralization, and death in the perinatal period due to respiratory insufficiency. {ECO:0000269PubMed:10627137, ECO:0000269PubMed:1460047, ECO:0000269PubMed:1511982, ECO:0000269PubMed:1613761, ECO:0000269PubMed:16566045, ECO:0000269PubMed:16786509, ECO:0000269PubMed:18670065, ECO:0000269PubMed:1874719, ECO:0000269PubMed:18996919, ECO:0000269PubMed:1939261, ECO:0000269PubMed:1953667, ECO:0000269PubMed:2035536, ECO:0000269PubMed:2036375, ECO:0000269PubMed:2037280, ECO:0000269PubMed:2116413, ECO:0000269PubMed:2211725, ECO:0000269PubMed:2339700, ECO:0000269PubMed:2470760, ECO:0000269PubMed:2777764, ECO:0000269PubMed:2794057, ECO:0000269PubMed:2913053, ECO:0000269PubMed:3016737, ECO:0000269PubMed:3108247, ECO:0000269PubMed:3403550, ECO:0000269PubMed:3667599, ECO:0000269PubMed:7520724, ECO:0000269PubMed:7679635, ECO:0000269PubMed:7691343, ECO:0000269PubMed:7961597, ECO:0000269PubMed:8100209, ECO:0000269PubMed:8349697, ECO:0000269PubMed:8349698, ECO:0000269PubMed:8364588, ECO:0000269PubMed:8456808, ECO:0000269PubMed:8786074, ECO:0000269PubMed:9143923, ECO:0000269Ref.45, ECO:0000269Ref.48}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Osteogenesis imperfecta 3 (OI3) [MIM:259420]: An autosomal dominant form of osteogenesis imperfecta, a connective tissue disorder characterized by low bone mass, bone fragility and susceptibility to fractures after minimal trauma. Disease severity ranges from very mild forms without fractures to intrauterine fractures and perinatal lethality. Extraskeletal manifestations, which affect a variable number of patients, are dentinogenesis imperfecta, hearing loss, and blue sclerae. OI3 is characterized by progressively deforming bones, very short stature, a triangular face, severe scoliosis, grayish sclera and dentinogenesis imperfecta. {ECO:0000269PubMed:10408781, ECO:0000269PubMed:16879195, ECO:0000269PubMed:1770532, ECO:0000269PubMed:18670065, ECO:0000269PubMed:2037280, ECO:0000269PubMed:2511192, ECO:0000269PubMed:2794057, ECO:0000269PubMed:7691343, ECO:0000269PubMed:7881420, ECO:0000269PubMed:8019571, ECO:0000269PubMed:8364588, ECO:0000269PubMed:8456809, ECO:0000269PubMed:8669434, ECO:0000269PubMed:8723681, ECO:0000269PubMed:9101304}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Osteogenesis imperfecta 4 (OI4) [MIM:166220]: An autosomal dominant form of osteogenesis imperfecta, a connective tissue disorder characterized by low bone mass, bone fragility and susceptibility to fractures after minimal trauma. Disease severity ranges from very mild forms without fractures to intrauterine fractures and perinatal lethality. Extraskeletal manifestations, which affect a variable number of patients, are dentinogenesis imperfecta, hearing loss, and blue sclerae. OI4 is characterized by moderately short stature, mild to moderate scoliosis, grayish or white sclera and dentinogenesis imperfecta. {ECO:0000269PubMed:16786509, ECO:0000269PubMed:16879195, ECO:0000269PubMed:1770532, ECO:0000269PubMed:17875077, ECO:0000269PubMed:1988452, ECO:0000269PubMed:2745420, ECO:0000269PubMed:7691343, ECO:0000269PubMed:7982948, ECO:0000269PubMed:8094076, ECO:0000269PubMed:8339541, ECO:0000269PubMed:9600458}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Osteoporosis (OSTEOP) [MIM:166710]: A systemic skeletal disorder characterized by decreased bone mass and deterioration of bone microarchitecture without alteration in the composition of bone. The result is fragile bones and an increased risk of fractures, even after minimal trauma. Osteoporosis is a chronic condition of multifactorial etiology and is usually clinically silent until a fracture occurs. {ECO:0000269PubMed:8841196, ECO:0000269PubMed:9535665}. Note=Disease susceptibility is associated with variations affecting the gene represented in this entry.Note=A chromosomal aberration involving COL1A1 is found in dermatofibrosarcoma protuberans. Translocation t(17;22)(q22;q13) with PDGF. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Forms the fibrils of tendon, ligaments and bones. In bones the fibrils are mineralized with calcium hydroxyapatite. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 50 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000885
Fibrillar collagen, C-terminal IPR001007 von Willebrand factor, type C IPR002181 Fibrinogen, alpha/beta/gamma chain, C-terminal globular domain IPR008160 Collagen triple helix repeat |
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PFAM |
PF01410
PF00093 PF00147 PF01391 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00038
SM00214 SM00186 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P02452 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P02452 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9UMA6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1277 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.743746 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_000079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 120150 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11561 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB209597 AF017178 BC036531 CH471109 J00110 J00111 J00112 J00113 J02829 J03559 K01228 K03179 L47667 M10627 M11162 M20789 M23213 M32798 M36546 M55998 S58915 S64596 X00820 X06269 X07884 X98705 Z74615 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA51847 AAA51992 AAA51993 AAA51995 AAA52036 AAA52049 AAA52052 AAA52289 AAA52290 AAA52291 AAA60150 AAA75386 AAB26324 AAB27856 AAB59363 AAB59373 AAB59576 AAB94054 AAH36531 AAN86574 BAD92834 CAA25394 CAA29605 CAA30731 CAA67261 CAA98968 EAW94630 EAW94631 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||