Homo sapiens Protein: PRPF4 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-81607.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRPF4 | ||||||||||||||||||
Protein Name | PRP4 pre-mRNA processing factor 4 homolog (yeast) | ||||||||||||||||||
Synonyms | HPRP4; HPRP4P; PRP4; Prp4p; RP70; SNRNP60; | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000363315 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-81603 (PRPF4) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Participates in pre-mRNA splicing. Part of the U4/U5/U6 tri-snRNP complex, one of the building blocks of the spliceosome. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle {ECO:0000250}. Note=Colocalizes with spliceosomal snRNPs. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 85 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001680
WD40 repeat IPR003648 Splicing factor motif IPR014906 Pre-mRNA processing factor 4 (PRP4)-like IPR017986 WD40-repeat-containing domain IPR020472 G-protein beta WD-40 repeat |
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PFAM |
PF00400
PF08799 |
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PRINTS |
PR00320
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PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00320
SM00500 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | O43172 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O43172 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5T1M7 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9128 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.741686 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001231855 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17349 | ||||||||||||||||||
OMIM | 607795 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS59142 | ||||||||||||||||||
HPRD | 08479 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AB209797 AF001687 AF016369 AL449305 AY572489 BC001588 BC007424 CH471090 U82756 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAB87640 AAC02261 AAC51925 AAH01588 AAH07424 AAS78572 BAD93034 CAI10968 EAW87362 EAW87363 | ||||||||||||||||||