Version 5.4
| Homo sapiens Protein: ATAD3B | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-85471.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | ATAD3B | ||||||||||||||||||
| Protein Name | ATPase family, AAA domain containing 3B | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSP00000311766 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-85469 (ATAD3B) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | May play a role in a mitochondrial network organization typical for stem cells, characterized by reduced mitochondrial metabolism, low mtDNA copies and fragmentated mitochondrial network. may act by suppressing ATAD3A function, interfering with ATAD3A interaction with matrix nucleoid complexes. {ECO:0000269PubMed:22664726}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Mitochondrion inner membrane {ECO:0000269PubMed:16909202, ECO:0000269PubMed:18063578}; Peripheral membrane protein {ECO:0000269PubMed:16909202, ECO:0000269PubMed:18063578}. Note=Has been found to co-purify with nucleoids (PubMed:22453275). Since it does not face the mitochondrial matrix, the association with nucleoids could be mediated by ATAD3A. {ECO:0000269PubMed:22453275}. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | Tends to be down-regulated in differentiated cells and re-expressed in pluripotent stem cells or cancer cells (at protein level). {ECO:0000269PubMed:16909202, ECO:0000269PubMed:22664726}. | ||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 28 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR003593
AAA+ ATPase domain IPR003959 ATPase, AAA-type, core IPR021911 ATPase family AAA domain-containing protein 3, domain of unknown function DUF3523 IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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| PFAM |
PF00004
PF07724 PF13304 PF12037 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00382
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q5T9A4 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q5T9A4 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | Q9H834 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 83858 | ||||||||||||||||||
| UniGene | |||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_114127 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:24007 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 612317 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS30 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 10679 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AB033099 AK024028 AK128357 AK290586 AL157945 BC002542 BC009938 BC018701 CH471183 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAH02542 AAH18701 BAA86587 BAB14787 BAF83275 CAI22068 EAW56193 | ||||||||||||||||||