Homo sapiens Protein: PRDM2 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-90605.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRDM2 | ||||||||||||||||||
Protein Name | PR domain containing 2, with ZNF domain | ||||||||||||||||||
Synonyms | HUMHOXY1; KMT8; MTB-ZF; RIZ; RIZ1; RIZ2; | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000235372 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-90601 (PRDM2) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | S-adenosyl-L-methionine-dependent histone methyltransferase that specifically methylates 'Lys-9' of histone H3. May function as a DNA-binding transcription factor. Binds to the macrophage-specific TPA-responsive element (MTE) of the HMOX1 (heme oxygenase 1) gene and may act as a transcriptional activator of this gene. {ECO:0000269PubMed:14633678}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:14633678, ECO:0000269PubMed:7538672, ECO:0000269PubMed:9006946}. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Highly expressed in retinoblastoma cell lines and in brain tumors. Also expressed in a number of other cell lines and in brain, heart, skeletal muscle, liver and spleen. Isoform 1 is expressed in testis at much higher level than isoform 3. {ECO:0000269PubMed:8654390, ECO:0000269PubMed:9006946}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 14 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001214
SET domain IPR007087 Zinc finger, C2H2 IPR009170 Predicted retinoblastoma binding protein (RIZ) IPR015880 Zinc finger, C2H2-like |
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PFAM |
PF00856
PF00096 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF002395
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SMART |
SM00317
SM00355 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q13029 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q13029 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | S4R3F7 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7799 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.613210 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_036363 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9347 | ||||||||||||||||||
OMIM | 601196 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS150 | ||||||||||||||||||
HPRD | 03120 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AL031277 AL359771 AL583942 BC014468 BX647310 CH471167 D45132 U17838 U23736 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAA87023 AAC50820 BAA08110 CAH70943 CAI19343 EAW51696 EAW51698 | ||||||||||||||||||