Homo sapiens Protein: COL5A1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-91763.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | COL5A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | collagen, type V, alpha 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000360882 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-91757 (COL5A1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Type V collagen is a member of group I collagen (fibrillar forming collagen). It is a minor connective tissue component of nearly ubiquitous distribution. Type V collagen binds to DNA, heparan sulfate, thrombospondin, heparin, and insulin. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted, extracellular space, extracellular matrix {ECO:0000255PROSITE-ProRule:PRU00793}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Ehlers-Danlos syndrome 1 (EDS1) [MIM:130000]: A connective tissue disorder characterized by hyperextensible skin, atrophic cutaneous scars due to tissue fragility and joint hyperlaxity. EDS1 is the severe form of classic Ehlers-Danlos syndrome. {ECO:0000269PubMed:10602121, ECO:0000269PubMed:15580559, ECO:0000269PubMed:18972565, ECO:0000269PubMed:9042913}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Ehlers-Danlos syndrome 2 (EDS2) [MIM:130010]: Mild form of classic Ehlers-Danlos syndrome. {ECO:0000269PubMed:11992482}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000885
Fibrillar collagen, C-terminal IPR001791 Laminin G domain IPR002181 Fibrinogen, alpha/beta/gamma chain, C-terminal globular domain IPR008160 Collagen triple helix repeat IPR008985 Concanavalin A-like lectin/glucanases superfamily |
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PFAM |
PF01410
PF00054 PF02210 PF00147 PF01391 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00038
SM00210 SM00282 SM00186 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P20908 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P20908 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9UML4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1289 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.712826 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_000084 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2209 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 120215 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6982 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00368 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB209864 AL591890 AL603650 AL645768 BC008760 CH471090 D90279 L38808 M76729 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA59993 AAA79853 AAH08760 BAA14323 BAD93101 CAI15483 CAI17261 CAI39859 EAW88128 EAW88130 EAW88131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||