Homo sapiens Protein: EIF2C1 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-96238.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | EIF2C1 | ||||||||||||||||||||||||
Protein Name | eukaryotic translation initiation factor 2C, 1 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000362300 | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-96234 (EIF2C1) | ||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||
Function | Required for RNA-mediated gene silencing (RNAi). Binds to short RNAs such as microRNAs (miRNAs) or short interfering RNAs (siRNAs), and represses the translation of mRNAs which are complementary to them. Lacks endonuclease activity and does not appear to cleave target mRNAs. Also required for transcriptional gene silencing (TGS) of promoter regions which are complementary to bound short antigene RNAs (agRNAs). {ECO:0000269PubMed:16289642, ECO:0000269PubMed:16936728, ECO:0000269PubMed:18771919}. | ||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, P-body {ECO:0000269PubMed:16289642, ECO:0000269PubMed:20616046}. | ||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 76 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003100
PAZ domain IPR003165 Stem cell self-renewal protein Piwi IPR012337 Ribonuclease H-like domain IPR014811 Domain of unknown function DUF1785 |
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PFAM |
PF02170
PF02171 PF08699 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00949
SM00950 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9UL18 | ||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9UL18 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5TA58 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 26523 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.656677 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_036331 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:3262 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | 606228 | ||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS398 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06942 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF093097 AL139286 BC063275 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF00068 AAH63275 CAI22804 | ||||||||||||||||||||||||