Version 5.4
| Homo sapiens Protein: LRRC7 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-99627.5 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | LRRC7 | ||||||||||||||||||
| Protein Name | leucine rich repeat containing 7 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSP00000035383 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-99619 (LRRC7) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | Required for normal synaptic spine architecture and function. Necessary for DISC1 and GRM5 localization to postsynaptic density complexes and for both N-methyl D-aspartate receptor-dependent and metabotropic glutamate receptor-dependent long term depression. {ECO:0000269PubMed:11729199}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:11729199}. Cell junction, synapse, postsynaptic cell membrane, postsynaptic density {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | Brain-specific. Isoform 3 is ubiquitously expressed. {ECO:0000269PubMed:12525888}. | ||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 17 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR001478
PDZ domain IPR001611 Leucine-rich repeat IPR003591 Leucine-rich repeat, typical subtype |
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| PFAM |
PF00595
PF13180 PF00560 PF13504 PF13855 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00228
SM00369 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q96NW7 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q96NW7 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 57554 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.387982 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_065845 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:18531 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 614453 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS645 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 09930 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AB037786 AF434715 AF498274 AL117353 AL157948 AL158840 AL359412 AL391728 CR749629 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAL28133 AAP06801 BAA92603 CAH18423 CAH70974 CAH70975 CAH73691 CAH73692 CAH74018 CAH74019 CAI22425 CAI22426 CAI23423 | ||||||||||||||||||