Homo sapiens Gene: SETDB1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-102210.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SETDB1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | SET domain, bifurcated 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | ESET; H3-K9-HMTase4; KG1T; KMT1E; TDRD21 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000143379 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SET domain, bifurcated 1
SET domain, bifurcated 1
SET domain, bifurcated 1
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SET domain, bifurcated 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a histone methyltransferase which regulates histone methylation, gene silencing, and transcriptional repression. This gene has been identified as a target for treatment in Huntington Disease, given that gene silencing and transcription dysfunction likely play a role in the disease pathogenesis. Alternatively spliced transcript variants of this gene have been described.[provided by RefSeq, Jun 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:150926263-150964744 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q21.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 165 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 10 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Wnt pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Lysine degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Noncanonical Wnt signaling pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.643565 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001145415 NM_001243491 NM_012432 XM_005245641 XM_006711672 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS44217 CCDS58026 CCDS972 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 06828 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||