Mus musculus Gene: Setdb1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-172468.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Setdb1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | SET domain, bifurcated 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AU022152; ESET; KMT1E; mKIAA0067 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000015697 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SET domain, bifurcated 1
SET domain, bifurcated 1
SET domain, bifurcated 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000143379:
This gene encodes a histone methyltransferase which regulates histone methylation, gene silencing, and transcriptional repression. This gene has been identified as a target for treatment in Huntington Disease, given that gene silencing and transcription dysfunction likely play a role in the disease pathogenesis. Alternatively spliced transcript variants of this gene have been described.[provided by RefSeq, Jun 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:95323525-95357202 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F2.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 16 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 113 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Lysine degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Wnt pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Lysine degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Noncanonical Wnt signaling pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.490259 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001163641 NM_001163642 NM_018877 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17613 CCDS50991 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||