Homo sapiens Gene: GGPS1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-107543.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | GGPS1 | ||||||||||||||||||
Gene Name | geranylgeranyl diphosphate synthase 1 | ||||||||||||||||||
Synonyms | GGPPS; GGPPS1 | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000152904 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
geranylgeranyl diphosphate synthase 1
geranylgeranyl diphosphate synthase 1
geranylgeranyl diphosphate synthase 1
geranylgeranyl diphosphate synthase 1
geranylgeranyl diphosphate synthase 1
geranylgeranyl diphosphate synthase 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the prenyltransferase family and encodes a protein with geranylgeranyl diphosphate (GGPP) synthase activity. The enzyme catalyzes the synthesis of GGPP from farnesyl diphosphate and isopentenyl diphosphate. GGPP is an important molecule responsible for the C20-prenylation of proteins and for the regulation of a nuclear hormone receptor. Alternate transcriptional splice variants, both protein-coding and non-protein-coding, have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:235327350-235344532 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q42.3 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Activation of gene expression by SREBF (SREBP) pathway
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) pathway
Cholesterol biosynthesis pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Terpenoid backbone biosynthesis pathway
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INOH |
Steroids metabolism pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | A8MVQ8 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9453 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.730768 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001037277 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:4249 | ||||||||||||||||||
OMIM | 606982 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1604 | ||||||||||||||||||
HPRD | 06099 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AK293278 AL391994 CH471098 | ||||||||||||||||||
GenPept | BAH11480 EAW70018 EAW70020 | ||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 9453 | ||||||||||||||||||