Mus musculus Gene: Amacr | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-129542.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Amacr | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | alpha-methylacyl-CoA racemase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Macr1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022244 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
alpha-methylacyl-CoA racemase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000242110:
This gene encodes a racemase. The encoded enzyme interconverts pristanoyl-CoA and C27-bile acylCoAs between their (R)- and (S)-stereoisomers. The conversion to the (S)-stereoisomers is necessary for degradation of these substrates by peroxisomal beta-oxidation. Encoded proteins from this locus localize to both mitochondria and peroxisomes. Mutations in this gene may be associated with adult-onset sensorimotor neuropathy, pigmentary retinopathy, and adrenomyeloneuropathy due to defects in bile acid synthesis. Alternatively spliced transcript variants have been described. Read-through transcription also exists between this gene and the upstream neighboring C1QTNF3 (C1q and tumor necrosis factor related protein 3) gene. [provided by RefSeq, Mar 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:10981756-10996624 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Synthesis of bile acids and bile salts via 24-hydroxycholesterol pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Synthesis of bile acids and bile salts pathway
Synthesis of bile acids and bile salts via 7alpha-hydroxycholesterol pathway
Beta-oxidation of pristanoyl-CoA pathway
Peroxisomal lipid metabolism pathway
Bile acid and bile salt metabolism pathway
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KEGG |
Primary bile acid biosynthesis pathway
Peroxisome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Beta-oxidation of pristanoyl-CoA pathway
Synthesis of bile acids and bile salts via 24-hydroxycholesterol pathway
Synthesis of bile acids and bile salts via 7alpha-hydroxycholesterol pathway
Synthesis of bile acids and bile salts pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Peroxisomal lipid metabolism pathway
Bile acid and bile salt metabolism pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Primary bile acid biosynthesis pathway
Peroxisome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.2787 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008537 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27381 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||