Mus musculus Gene: Arid1b | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-132856.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Arid1b | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | AT rich interactive domain 1B (SWI-like) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000069729 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
AT rich interactive domain 1B (SWI-like)
AT rich interactive domain 1B (SWI-like)
AT rich interactive domain 1B (SWI-like)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000049618:
This locus encodes an AT-rich DNA interacting domain-containing protein. The encoded protein is a component of the SWI/SNF chromatin remodeling complex and may play a role in cell-cycle activation. The protein encoded by this locus is similar to AT-rich interactive domain-containing protein 1A. These two proteins function as alternative, mutually exclusive ARID-subunits of the SWI/SNF complex. The associated complexes play opposing roles. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Feb 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:4994332-5347656 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 16 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 23 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Chromatin organization pathway
RMTs methylate histone arginines pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.133401 Mm.367028 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001085355 XM_006523222 XM_006523224 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS49929 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||